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AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.317;DP=24;Dels=0.00;FS=1.971;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:312,0,296 1 13182542 . A G 907.47 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.113;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=17.79;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,35:51:99:937,0,368 1 13182544 . T C 940.21 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.476;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=18.80;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,34:50:99:970,0,397 1 13182567 . G C 782.87 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.184;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,33:49:99:813,0,382 1 13182636 . C T 418.56 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.929;DP=33;Dels=0.00;FS=7.223;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.87;MQ0=2;MQRankSum=-1.531;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:449,0,277 1 13182650 . G A 299.77 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.180;DP=30;Dels=0.00;FS=6.648;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.55;MQ0=2;MQRankSum=-2.289;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:330,0,352 1 13182653 . A T 241.11 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;DP=29;Dels=0.00;FS=4.310;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.35;MQ0=2;MQRankSum=-1.645;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:271,0,359 1 13182828 . C T 146.31 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;DP=34;Dels=0.00;FS=11.885;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=4.30;ReadPosRankSum=-2.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:176,0,537 1 13182829 . A G 859.72 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:75.23:893,75,0 1 13182899 . A G 1026.80 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.970;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.10;MQ0=24;MQRankSum=0.176;QD=14.46;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,53:71:99:1057,0,149 1 13182929 . T A 148.90 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;DP=61;Dels=0.00;FS=5.497;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=20.06;MQ0=40;MQRankSum=-1.447;QD=2.44;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,31:61:99:179,0,223 1 13183310 . G A 146.36 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.389;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=31.57;MQ0=15;MQRankSum=2.150;QD=2.06;ReadPosRankSum=-1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,11:71:99:176,0,856 1 13183422 . T C 227.69 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.803;DP=102;Dels=0.00;FS=8.747;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=36.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=2.23;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,22:102:99:258,0,1774 1 13183439 . T C 2290 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.01;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.78;MQ0=0;QD=22.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:2323,196,0 1 13183511 . T C 283.72 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.566;DP=67;Dels=0.00;FS=1.309;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.16;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:314,0,639 1 13183528 . A C 57.36 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.233;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.79;MQ0=0;MQRankSum=1.167;QD=1.02;ReadPosRankSum=-0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:87.35:87,0,623 1 13183966 . G T 260.03 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.734;DP=32;Dels=0.00;FS=19.590;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=17.72;MQ0=13;MQRankSum=1.734;QD=8.13;ReadPosRankSum=1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:13.29:290,0,13 1 13183973 . G A 38.62 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.333;DP=33;Dels=0.00;FS=30.004;HRun=2;HaplotypeScore=0.9933;MQ=18.78;MQ0=11;MQRankSum=-0.778;QD=1.17;ReadPosRankSum=-1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:68.61:69,0,235 1 13184045 . A G 75.98 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.93;MQ0=4;MQRankSum=0.365;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:106,0,176 1 13184079 . A AT 234.30 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.257;DP=22;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=227.1651;MQ=33.47;MQ0=4;MQRankSum=-1.678;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:18:99:273,0,255 1 13184095 . C A 221.18 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.835;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=13.01;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:251,0,106 1 13184097 . C A 188.06 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=17;Dels=0.00;FS=4.393;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:218,0,110 1 13184105 . T C 221.18 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.289;DP=15;Dels=0.00;FS=4.771;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:251,0,108 1 13184221 . C T 314.52 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.859;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.658;QD=12.58;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:345,0,163 1 13736807 . C T 42.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=17.32;MQ0=1;QD=10.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:8.99:74,9,0 1 16200163 . A G 516.65 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;DP=39;Dels=0.00;FS=3.064;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=13.25;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:547,0,438 1 16245615 . T C 114.54 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.380;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.367;QD=8.18;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:145,0,215 1 16256007 . T C 133.88 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.955;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:164,0,342 1 16259813 . A G 124.85 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:155,0,441 1 16265422 . A G 208.27 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.468;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:238,0,235 1 17312743 . C T 32.37 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=4.62;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:26.23:62,0,26 1 17313343 . G A 153.19 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=2.072;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:183,0,112 1 17313454 . G A 404.36 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.648;DP=32;Dels=0.00;FS=4.393;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:434,0,218 1 17313654 . C T 58.59 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=7.32;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:88.58:89,0,89 1 17314702 . C T 381.54 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.284;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:412,0,449 1 17314942 . G A 46.55 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=1.79;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:76.54:77,0,219 1 17319011 . G A 210.40 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.772;DP=23;Dels=0.00;FS=2.158;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:240,0,204 1 17323198 . A T 56.45 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=12;Dels=0.00;FS=3.680;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:86.45:86,0,122 1 20964328 . A G 67.63 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.326;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=3.22;ReadPosRankSum=-1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:97.63:98,0,349 1 20965139 . C CAA 327.39 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;DP=14;FS=6.264;HRun=4;HaplotypeScore=143.9756;MQ=37.80;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=23.38;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:366,0,116 1 20965375 . T C 397.86 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.783;DP=52;Dels=0.00;FS=1.301;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=7.65;ReadPosRankSum=-1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:428,0,609 1 20965407 rs373286944 A C 672.37 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.868;DB;DP=65;Dels=0.00;FS=7.583;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.170;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,27:65:99:702,0,878 1 20965771 . A G 657.67 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;DP=45;Dels=0.00;FS=6.198;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=14.61;ReadPosRankSum=1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,29:45:99:688,0,293 1 20965942 . G A 317.93 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.512;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.635;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:348,0,455 1 20972048 . G A 254.68 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.185;DP=35;Dels=0.00;FS=3.424;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.71;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:35:71.40:285,0,71 1 20975168 . C T 522.09 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;DP=51;Dels=0.00;FS=1.243;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:552,0,596 1 20977221 . A T 451.67 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.229;DP=46;Dels=0.00;FS=1.415;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,24:46:99:482,0,410 1 20977365 . C G 377.26 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:407,0,159 1 20977449 . G T 57.73 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;DP=29;Dels=0.00;FS=5.614;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=1.99;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:87.72:88,0,446 1 20977854 . A ATTC 888.58 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.396;DP=58;FS=11.572;HRun=0;HaplotypeScore=298.8688;MQ=37.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=15.32;ReadPosRankSum=-0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:58:99:928,0,1432 1 20978058 . G A 167 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.811;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=5.96;ReadPosRankSum=2.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:197,0,339 1 21785981 . G T 74.60 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9.03:107,9,0 1 21786025 . A G 85.69 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.361;DP=10;Dels=0.00;FS=2.808;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:116,0,151 1 21786176 . A G 147.91 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:15.05:181,15,0 1 21786251 . T C 74.60 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9.03:107,9,0 1 23271815 . A C 40.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:71,6,0 1 23632626 . G C 253.44 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24.07:286,24,0 1 23633278 . G A 110.27 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12.04:143,12,0 1 23636015 . GT G 65.25 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;HRun=13;HaplotypeScore=170.5984;MQ=37.93;MQ0=0;QD=5.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,9:12:14.86:107,15,0 1 23664511 . T G 1005.11 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:87.27:1038,87,0 1 24294587 . G A 215.99 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=17.25;MQ0=7;QD=13.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:27.03:249,27,0 1 24302765 . T C 456.45 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.33;MQ0=0;QD=26.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:42.12:489,42,0 1 25578944 . A G 111.15 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12.04:144,12,0 1 28880336 . T A 996.05 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.126;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=13.64;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,44:73:99:1026,0,453 1 28887031 . A G 33.25 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:26.23:63,0,26 1 28904895 . G GACTT 818.75 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.560;DP=34;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=246.5734;MQ=37.99;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=24.08;ReadPosRankSum=0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:34:99:858,0,480 1 29474134 rs574718912 A C 41.02 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:72,6,0 1 29475341 . C T 360.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:33.10:394,33,0 1 29475394 rs553259319 C G 253.44 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:24.07:286,24,0 1 29475648 . T G 719.58 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.75;MQ0=0;QD=17.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:63.19:753,63,0 1 29486353 . G GA 75.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;HRun=9;HaplotypeScore=72.7114;MQ=38.59;MQ0=0;QD=10.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,5:7:11.98:117,12,0 1 29508350 . C T 31.49 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=4.50;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:27.10:61,0,27 1 31961711 . T G 41.02 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:72,6,0 1 32897098 . A G 40.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6.02:71,6,0 1 35643337 . A G 84.43 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.133;DP=13;Dels=0.00;FS=6.990;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.866;QD=6.49;ReadPosRankSum=1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:114,0,184 1 35648492 . G A 92.60 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.880;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=3.43;ReadPosRankSum=-1.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:123,0,446 1 39987899 . G A 111.15 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.58;MQ0=2;QD=13.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,5:8:12.04:144,12,0 1 39989327 . C T 59.46 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:89.46:89,0,89 1 40204823 . C T 528.19 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.366;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=13.20;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,24:40:99:558,0,275 1 40207169 . T G 262.85 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;DP=24;Dels=0.00;FS=6.690;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.148;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:293,0,329 1 40211737 . T C 447.38 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.746;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:477,0,120 1 40212878 . G A 180.31 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.486;DP=29;Dels=0.00;FS=1.941;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,8:29:99:210,0,535 1 40212957 . T C 231.48 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;DP=20;Dels=0.00;FS=2.098;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:261,0,333 1 40213670 . A T 93.86 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=23;Dels=0.00;FS=4.868;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=4.08;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:124,0,409 1 40213890 . C T 196.61 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.206;DP=23;Dels=0.00;FS=2.199;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:227,0,336 1 40214367 . A G 95.59 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=8;Dels=0.00;FS=3.310;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:53.33:126,0,53 1 40214375 . G C 91.71 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=9;Dels=0.00;FS=3.680;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:86.45:122,0,86 1 40214525 . T A 157.95 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.001;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=14.36;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:80.43:188,0,80 1 40219065 . C T 337.74 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,24:49:99:368,0,258 1 40219280 . T C 94.74 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.591;DP=29;Dels=0.00;FS=15.315;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.577;QD=3.27;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:125,0,409 1 40220284 . C G 55.58 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:85.58:86,0,115 1 40220806 . G A 350.18 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.138;DP=43;Dels=0.00;FS=1.515;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=8.14;ReadPosRankSum=-1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:380,0,452 1 40221067 . G A 290.83 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=34;Dels=0.00;FS=21.075;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:321,0,392 1 40221464 . T C 506.25 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;DP=59;Dels=0.00;FS=21.408;HRun=1;HaplotypeScore=0.9989;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=8.58;ReadPosRankSum=-1.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,30:59:99:536,0,501 1 45880751 . C T 215.59 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:21.06:249,21,0 1 47358321 . T A 50.96 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=21.00;MQ0=1;QD=8.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9.01:83,9,0 1 52665335 . G A 39.26 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:71,6,0 1 53357938 . G A 40.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:71,6,0 1 65297240 . A G 741.10 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=46;Dels=0.00;FS=1.268;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,28:46:99:771,0,449 1 65297855 . CTAT C 246.91 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.380;DP=23;FS=2.199;HRun=0;HaplotypeScore=161.6023;MQ=37.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:286,0,727 1 65297983 . A T 277.90 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;DP=27;Dels=0.00;FS=21.182;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.464;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:308,0,167 1 65298623 . AAGTC A 402.59 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.550;DP=25;FS=2.017;HRun=0;HaplotypeScore=238.6710;MQ=37.95;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=16.10;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:442,0,638 1 67875102 . ACC A 38.98 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;DP=19;FS=3.680;HRun=5;HaplotypeScore=265.2479;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.652;QD=2.05;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:27.01:78,0,27 1 67875203 . C T 419.92 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;DP=36;Dels=0.00;FS=6.107;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:450,0,451 1 67876484 . C T 137.76 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.271;DP=19;Dels=0.00;FS=2.307;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,6:19:99:168,0,311 1 68126096 . C A 75.48 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:108,9,0 1 68126437 . G A 39.26 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6.02:71,6,0 1 70715056 . G A 338.52 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.022;DP=35;Dels=0.00;FS=5.812;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=9.67;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:369,0,550 1 70718273 . A ATT 527.50 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=104.5580;MQ=37.58;MQ0=0;QD=40.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:33.11:570,33,0 1 72034921 . A G 40.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:71,6,0 1 78761547 . C T 40.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6.02:71,6,0 1 78762051 . C T 145.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:15.05:178,15,0 1 78762196 . T G 122.13 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.17;MQ0=0;QD=17.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:15.01:155,15,0 1 80556027 . G A 183.91 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:18.06:217,18,0 1 80556153 . TA T 138.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;HRun=7;HaplotypeScore=38.2995;MQ=31.17;MQ0=2;QD=15.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:7:18.04:181,18,0 1 80916795 . T C 219.09 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:21.06:252,21,0 1 81892507 . A T 58.59 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=9;Dels=0.00;FS=3.979;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:88.58:89,0,89 1 81892826 . C T 146.79 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:177,0,213 1 81892985 . T C 252.93 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:71.40:283,0,71 1 81893020 . G C 163.11 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.887;DP=37;Dels=0.00;FS=4.867;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:193,0,371 1 81893296 . G A 360.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:394,33,0 1 81893855 . C T 111.15 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12.04:144,12,0 1 89418231 . G A 39.26 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:71,6,0 1 89447978 . T A 471.85 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.956;DP=54;Dels=0.00;FS=1.824;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=32.20;MQ0=0;MQRankSum=-3.954;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,31:54:99:502,0,452 1 89449399 . T C 65.98 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.845;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.99;MQ0=2;MQRankSum=-0.990;QD=1.08;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,9:61:95.97:96,0,815 1 96914049 . C T 61.60 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:56.34:92,0,56 1 97188394 . G T 348.92 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.417;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=9.43;ReadPosRankSum=1.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:379,0,483 1 97189091 . G A 437 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.847;DP=43;Dels=0.00;FS=1.356;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=10.16;ReadPosRankSum=-1.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:467,0,547 1 97272456 . A G 392.82 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.742;DP=36;Dels=0.00;FS=5.988;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=10.91;ReadPosRankSum=1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:423,0,381 1 97278804 . G A 86.95 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:117,0,118 1 97279692 . C T 836.20 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=2.037;DP=61;Dels=0.00;FS=2.622;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=13.71;ReadPosRankSum=1.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,35:61:99:866,0,502 1 98051513 . T TC 324.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=89.5046;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:27.08:367,27,0 1 101407028 . A T 65.49 . 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AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:298,0,299 1 106240280 . G A 176.90 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.289;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=6;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:207,0,241 1 106432377 . A G 81.80 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=8.18;ReadPosRankSum=-2.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:112,0,186 1 106434008 . C T 438.58 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.98;MQ0=1;QD=23.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:45.09:472,45,0 1 106435371 . T C 246.91 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.467;QD=14.52;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:277,0,137 1 106435772 . T G 74.53 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.312;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=4.14;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:99:105,0,282 1 109386757 . G A 40.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:71,6,0 1 109759998 . A G 360.04 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:33.10:393,33,0 1 109771063 . T C 970.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:84.26:1004,84,0 1 109774026 . G A 1325.02 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:12.04:144,12,0 1 110883569 . A T 331.25 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.914;DP=78;Dels=0.00;FS=5.819;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,33:78:99:361,0,642 1 111833517 . G A 110.27 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:143,12,0 1 113993588 . G A 283.40 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;DP=31;Dels=0.00;FS=2.218;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.18;MQ0=1;MQRankSum=-0.046;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:313,0,267 1 116398616 . T C 75.48 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9.03:108,9,0 1 116399835 . C T 172.73 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;DP=31;Dels=0.00;FS=10.139;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.88;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=5.57;ReadPosRankSum=-0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:203,0,533 1 116400012 . T C 159.22 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.396;DP=27;Dels=0.00;FS=11.532;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:189,0,403 1 116400329 . C G 85.69 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.361;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=6.12;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:116,0,153 1 119627856 . C T 120.94 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.881;DP=18;Dels=0.00;FS=2.808;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:151,0,117 1 121485071 . C A 40.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:71,6,0 1 121485251 . A T 31.68 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.81;MQ0=0;QD=7.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6.01:63,6,0 1 121485379 . C T 44.48 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.9789;MQ=29.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=11.12;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:23.24:74,0,23 1 144612173 . A G 50.34 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.920;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=17.02;MQ0=0;MQRankSum=1.452;QD=1.74;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:80.33:80,0,208 1 144612217 . C T 39.80 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=14.12;MQ0=5;MQRankSum=0.550;QD=3.06;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:47.12:70,0,47 1 145507826 . A T 65.49 . 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AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.549;DP=22;Dels=0.00;FS=2.199;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=15.55;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:372,0,191 1 146524039 . A G 149.80 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.378;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=5.55;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:180,0,178 1 146524094 . C T 217.69 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.968;DP=31;Dels=0.00;FS=1.548;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=7.02;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:248,0,464 1 146524215 . C T 76.66 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.289;DP=33;Dels=0.00;FS=2.398;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=2.32;ReadPosRankSum=-1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:107,0,249 1 149900166 . C T 307.15 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.148;DP=48;Dels=0.00;FS=5.853;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=6.40;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:337,0,552 1 151177907 . T C 41.02 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:72,6,0 1 151672658 . C T 394.47 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.974;DP=43;Dels=0.00;FS=1.502;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:424,0,678 1 151675414 . A G 822.71 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:72.22:856,72,0 1 151675486 . A G 378.13 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:408,0,157 1 151675618 . T C 539.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:48.15:573,48,0 1 151681567 . G A 366.10 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.527;DP=42;Dels=0.00;FS=2.192;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,21:42:99:396,0,287 1 151898037 . T G 32.37 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=4.771;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26.23:62,0,26 1 153636401 . A G 32.37 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27.10:62,0,27 1 153636474 . G C 126.08 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=14.01;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:49.44:156,0,49 1 153642372 . G T 743.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.69;MQ0=0;QD=22.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:66.20:777,66,0 1 153642835 . G C 214.71 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:21.06:248,21,0 1 154127736 . A G 32.37 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:26.23:62,0,26 1 154127820 . T C 204.38 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.433;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:234,0,271 1 154135445 rs774315423 T C 60.34 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DB;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:88.58:90,0,89 1 154137165 . C T 170.38 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;DP=20;Dels=0.00;FS=5.119;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:200,0,272 1 154139165 . C CTT 42.88 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=16;FS=0.000;HRun=12;HaplotypeScore=248.0355;MQ=37.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=2.68;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:16:31.60:82,0,32 1 154141908 . A G 276.66 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=7.69;ReadPosRankSum=1.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:307,0,555 1 154142265 . T C 360.46 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,23:42:99:390,0,320 1 154144681 . A T 520.04 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.781;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=13.33;ReadPosRankSum=2.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:550,0,369 1 154145532 . C G 475.76 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=11.06;ReadPosRankSum=-2.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:506,0,508 1 154156329 . T C 39.26 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:6.02:71,6,0 1 154164082 . C T 223.33 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.220;DP=28;Dels=0.00;FS=6.415;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.64;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:253,0,430 1 154167116 . A G 194.08 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.179;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:44.30:224,0,44 1 154474875 . G A 40.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6.02:71,6,0 1 154475330 . T A 323.04 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:30.09:356,30,0 1 154475331 . C A 323.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:30.09:357,30,0 1 154479657 . C CAT 894.97 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=256.7118;MQ=38.50;MQ0=0;QD=42.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:49.05:937,49,0 1 154479670 . C T 502.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=38.31;MQ0=0;QD=20.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:45.14:536,45,0 1 154481153 . C G 32.37 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26.23:62,0,26 1 154481158 . T C 75.48 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:108,9,0 1 154492702 . G A 502.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:45.14:536,45,0 1 154493721 . T C 74.60 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:107,9,0 1 154494082 . G C 39.26 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:71,6,0 1 154514331 . C A 39.26 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6.02:71,6,0 1 154516477 . G A 301.99 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=7.19;ReadPosRankSum=1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:332,0,261 1 154516571 . T C 643.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:57.17:677,57,0 1 155184975 . A G 297.64 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.39;MQ0=7;QD=11.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,21:25:30.07:331,30,0 1 155186729 . T C 362.67 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:33.10:396,33,0 1 155186742 . G A 116.68 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.466;DP=14;Dels=0.00;FS=12.175;HRun=1;HaplotypeScore=0.9989;MQ=36.18;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:147,0,183 1 155197268 . T C 40.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:71,6,0 1 155205669 . G T 301.66 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.65;MQ0=2;QD=13.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:33.06:335,33,0 1 155206167 . C T 299.48 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.576;DP=34;Dels=0.00;FS=1.971;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:329,0,326 1 155206341 . T G 76.35 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9.03:108,9,0 1 155208647 . T G 434.05 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.76;MQ0=2;QD=25.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:39.12:467,39,0 1 155209360 . C T 323.04 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:30.09:356,30,0 1 155214473 . A G 286.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:27.08:320,27,0 1 155228710 . A G 224.59 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.536;DP=29;Dels=0.00;FS=6.193;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:255,0,401 1 155231545 . T G 42.67 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;DP=16;Dels=0.00;FS=3.090;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.67;ReadPosRankSum=1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:72.66:73,0,252 1 155232074 . C T 123.08 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=4.24;ReadPosRankSum=-1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:82.56:153,0,83 1 156713512 . C T 218.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=16.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:21.06:251,21,0 1 156728849 . T C 253.82 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:284,0,429 1 157403213 . A G 111.15 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12.04:144,12,0 1 157403321 . G A 92.58 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=8;Dels=0.00;FS=3.680;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:84.69:123,0,85 1 162467014 . C G 177.28 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=7.09;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:207,0,208 1 162470164 . AGGG A 249.14 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.964;DP=30;FS=1.983;HRun=4;HaplotypeScore=232.1829;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=8.30;ReadPosRankSum=2.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,7:30:99:288,0,1223 1 162470191 . C T 248.68 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;DP=37;Dels=0.00;FS=1.775;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=6.72;ReadPosRankSum=-1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:279,0,495 1 162470503 . G A 552.68 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.108;DP=47;Dels=0.00;FS=8.827;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=11.76;ReadPosRankSum=-0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,23:47:99:583,0,696 1 162493123 . A G 211.30 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;DP=32;Dels=0.00;FS=8.975;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:241,0,564 1 162493665 . T G 460.34 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.724;DP=46;Dels=0.00;FS=6.983;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:490,0,700 1 162494683 . G T 359.20 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.027;DP=34;Dels=0.00;FS=3.188;HRun=6;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:389,0,353 1 162497663 . G A 122.22 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;DP=25;Dels=0.00;FS=4.887;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.691;QD=4.89;ReadPosRankSum=1.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:152,0,439 1 162498459 . TA T 108.27 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=13;FS=3.680;HRun=8;HaplotypeScore=53.0925;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:44.92:147,0,45 1 162498599 . T C 135.70 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;DP=15;Dels=0.00;FS=5.756;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:166,0,211 1 162498946 . A G 610.76 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.931;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:641,0,425 1 166244927 . T C 361.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.75;MQ0=0;QD=24.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:33.10:395,33,0 1 166244970 . C CA 478.62 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=449.6331;MQ=37.90;MQ0=0;QD=19.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:45.39:521,45,0 1 166245037 . A G 538.93 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.47;MQ0=0;QD=22.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:48.15:572,48,0 1 166245170 . G C 111.15 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:12.04:144,12,0 1 166246419 . A G 422.96 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.31;MQ0=2;QD=18.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:39.11:456,39,0 1 166246864 . G A 361.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:33.10:395,33,0 1 169890574 . T A 357.07 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.821;DP=28;Dels=0.00;FS=1.580;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.75;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:387,0,385 1 169890933 . A G 312.79 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.262;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=8.69;ReadPosRankSum=-2.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:343,0,524 1 169941761 . A T 539.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:48.15:573,48,0 1 169951748 . A G 146.15 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:179,15,0 1 169951997 . C T 197.11 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.427;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=8.21;ReadPosRankSum=-1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:227,0,370 1 169952385 . G T 432.30 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:39.12:465,39,0 1 169985796 rs547765054 A G 203.13 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.022;DB;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:233,0,303 1 170004722 . G A 227.60 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.675;DP=25;Dels=0.00;FS=2.570;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.096;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:258,0,364 1 170043851 . C T 92.58 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=6.17;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:86.45:123,0,86 1 170043904 . G C 181.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:18.05:214,18,0 1 171639504 . A G 191.07 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.546;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.818;QD=11.24;ReadPosRankSum=-1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:76.54:221,0,77 1 171639719 . T C 152.81 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.031;DP=23;Dels=0.00;FS=2.463;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.03;MQ0=7;MQRankSum=1.031;QD=6.64;ReadPosRankSum=1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:183,0,146 1 171639868 . C T 417.67 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;DP=43;Dels=0.00;FS=3.471;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:448,0,413 1 172585656 . A G 251.68 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:24.07:285,24,0 1 173320886 . C T 109.40 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:7:12.04:142,12,0 1 179425089 . C A 98.62 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=12;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.61;MQ0=1;MQRankSum=-0.731;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20.21:129,0,20 1 185139864 . G A 41.02 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:72,6,0 1 191115638 . C T 70.64 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.354;DP=15;Dels=0.00;FS=2.836;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=4.71;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:101,0,316 1 194158916 . A G 89.77 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.377;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.931;QD=5.28;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:81.72:120,0,82 1 199357243 . A G 110.66 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.533;DP=19;Dels=0.00;FS=2.276;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.855;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:141,0,247 1 202881302 . C T 105.90 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=7.06;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:136,0,281 1 202881609 . T C 146.79 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.493;DP=17;Dels=0.00;FS=2.522;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:177,0,209 1 205720078 . G A 75.48 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9.03:108,9,0 1 212763354 . T C 191.07 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.27;MQ0=3;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,9:11:21.04:224,21,0 1 212763439 . T C 75.48 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:108,9,0 1 212763530 . T G 41.02 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:72,6,0 1 225262007 rs534845277 A G 40.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:71,6,0 1 227680783 . T C 34.96 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=2.91;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:64.96:65,0,89 1 229840914 . G T 80.55 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;DP=18;Dels=0.00;FS=2.398;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.36;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=4.48;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:111,0,210 1 229840921 . A C 139.90 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;DP=22;Dels=0.00;FS=5.021;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=6.36;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:170,0,269 1 231254003 . G A 33.25 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26.23:63,0,26 1 233051142 . A G 352.66 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.32;MQ0=0;QD=23.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:33.10:386,33,0 1 235294537 . G C 245.27 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.635;DP=18;Dels=0.00;FS=3.590;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:275,0,201 1 235299492 . C T 399.24 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.578;DP=50;Dels=0.00;FS=1.715;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.278;QD=7.98;ReadPosRankSum=-1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,21:50:99:429,0,643 1 235324553 . A G 263.24 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.78;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=5.85;ReadPosRankSum=-1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,28:45:99:293,0,263 1 241082927 . GA G 92.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=81.3541;MQ=36.36;MQ0=0;QD=15.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:13.82:135,14,0 1 241084246 . C CT 32.65 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=6;FS=0.000;HRun=10;HaplotypeScore=97.5286;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:5.97:73,6,0 2 9158162 . T C 111.15 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12.04:144,12,0 2 26251361 . A G 40.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6.02:71,6,0 2 29670834 . A G 40.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:71,6,0 2 32312700 . T C 75.79 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=5.41;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:106,0,251 2 32324072 . T C 90.45 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.638;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:120,0,118 2 32324135 . G A 75.48 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:108,9,0 2 32369901 . T C 76.35 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:108,9,0 2 32381727 . A AAGG 275.04 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=30.0517;MQ=38.85;MQ0=0;QD=45.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:6:15.05:317,15,0 2 32381829 rs62136272 G A 271.50 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.612;DB;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=12.34;ReadPosRankSum=1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:301,0,264 2 38789191 . T A 825.34 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:72.22:858,72,0 2 38789508 . T A 899.35 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:78.24:932,78,0 2 38789682 rs540011730 A G 967.23 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:84.26:1000,84,0 2 38793110 . G GT 120.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=11;FS=8.451;HRun=9;HaplotypeScore=149.9717;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,9:11:8.23:162,8,0 2 38971641 . T TCA 1505.40 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=161.3064;MQ=38.16;MQ0=0;QD=51.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:29:79.82:1547,80,0 2 38977371 . C T 360.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:33.10:394,33,0 2 38977402 . T C 321.29 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:30.09:354,30,0 2 38977505 . T C 75.48 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:108,9,0 2 38977835 . T TA 181.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;HRun=8;HaplotypeScore=192.5697;MQ=38.59;MQ0=0;QD=12.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:21.78:223,22,0 2 41384390 . G A 207.39 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.56;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=9.02;ReadPosRankSum=-3.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:237,0,233 2 42077583 . T C 111.09 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.788;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.10;MQ0=1;MQRankSum=2.793;QD=5.85;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:141,0,160 2 42077586 . C A 126.22 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.101;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.42;MQ0=1;MQRankSum=-2.074;QD=6.31;ReadPosRankSum=0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:156,0,176 2 42077657 . T C 139.89 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.237;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:170,0,277 2 44292977 . C T 74.60 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:107,9,0 2 48166824 . C A 180.29 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;DP=21;Dels=0.00;FS=9.890;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:210,0,175 2 54278667 . T C 219.09 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:21.06:252,21,0 2 56977912 . T G 322.16 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:30.09:355,30,0 2 62047358 . C G 146.15 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:179,15,0 2 62047563 . C A 538.93 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.38;MQ0=0;QD=23.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:48.15:572,48,0 2 68352515 . A C 157.07 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:80.43:187,0,80 2 71503874 . T C 65.49 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:23.22:95,0,23 2 71558924 . G T 141.15 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;DP=39;Dels=0.00;FS=8.616;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=3.62;ReadPosRankSum=-1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:171,0,245 2 71575470 . A T 76.35 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9.03:108,9,0 2 71606686 . A G 176.40 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;DP=20;Dels=0.00;FS=1.987;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:206,0,207 2 71615390 rs557816555 T G 386.31 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.115;DB;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.861;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:416,0,415 2 71615534 . C T 707.52 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.621;DP=78;Dels=0.00;FS=4.055;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.552;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,38:78:99:738,0,742 2 71615571 . C T 1101.23 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.84;MQ0=0;QD=17.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:96.29:1134,96,0 2 71620563 rs370898927 A G 323.45 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.934;DB;DP=48;Dels=0.00;FS=10.020;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.819;QD=6.74;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:353,0,359 2 71620818 . C T 322.16 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:30.09:355,30,0 2 71622610 . C T 255.96 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.767;DP=28;Dels=0.00;FS=21.256;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:286,0,397 2 71625767 . G A 212.53 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.715;DP=15;Dels=0.00;FS=2.688;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:243,0,170 2 71631109 . A G 383.30 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.069;DP=33;Dels=0.00;FS=3.696;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:413,0,450 2 71634588 . G A 41.02 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6.02:72,6,0 2 71635462 . T G 185.45 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.292;DP=24;Dels=0.00;FS=5.706;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=7.73;ReadPosRankSum=-1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:215,0,471 2 71635931 . G T 684.33 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:60.18:717,60,0 2 71651939 rs147267526 T A 219.09 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:21.06:252,21,0 2 71654175 . G A 667.97 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;DP=45;Dels=0.00;FS=2.807;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=14.84;ReadPosRankSum=-1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,27:45:99:698,0,522 2 71654450 . A G 261.59 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;DP=24;Dels=0.00;FS=1.740;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:292,0,364 2 71658364 . C T 378.63 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.109;DP=21;Dels=0.00;FS=5.379;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.506;QD=18.03;ReadPosRankSum=1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:409,0,190 2 71658541 . C T 302.87 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.368;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:333,0,260 2 71660495 . T TC 467.10 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.277;DP=49;FS=3.155;HRun=6;HaplotypeScore=569.8790;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.873;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,27:49:99:506,0,297 2 71660804 . C T 147.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:180,15,0 2 71661855 . C CA 168.31 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;DP=15;FS=6.410;HRun=3;HaplotypeScore=88.6428;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:99:207,0,245 2 71661968 . T G 560.44 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;DP=35;Dels=0.00;FS=3.473;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=16.01;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:590,0,270 2 74589288 . G C 310.64 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.268;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:35:99:341,0,195 2 74589897 . G T 518.79 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.855;DP=46;Dels=0.00;FS=16.487;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=2.754;QD=11.28;ReadPosRankSum=-1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,22:46:99:549,0,403 2 74591760 . T C 325.21 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;DP=31;Dels=0.00;FS=4.310;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:355,0,359 2 74595716 rs758056062 G A 374.27 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.171;DB;DP=38;Dels=0.00;FS=1.340;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:404,0,547 2 74598999 . AAAG A 348.97 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;DP=21;FS=1.808;HRun=0;HaplotypeScore=170.5646;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=16.62;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:388,0,604 2 74600553 rs758186300 A C 92.58 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.300;DB;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:85.57:123,0,86 2 74605898 . T C 66.37 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=13.27;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:23.22:96,0,23 2 74644198 . A G 190.19 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=15;Dels=0.00;FS=3.010;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=12.68;ReadPosRankSum=1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:76.54:220,0,77 2 74644277 . T C 159.20 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=10;Dels=0.00;FS=3.332;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:47.31:189,0,47 2 88460741 . C T 40.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:71,6,0 2 98021637 . A C 252.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24.07:286,24,0 2 106869808 . C T 123.95 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:82.56:154,0,83 2 106870091 . G A 180.58 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.890;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=20.35;MQ0=10;MQRankSum=-1.550;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:211,0,266 2 127927731 . G A 394.42 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=16.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:36.11:427,36,0 2 127927732 . G A 430.55 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:39.12:464,39,0 2 127927936 . T A 233.62 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=7.79;ReadPosRankSum=-2.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:264,0,299 2 127927943 . G A 355.32 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.590;QD=11.10;ReadPosRankSum=-3.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:385,0,388 2 127927990 . G A 456.81 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.023;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=12.35;ReadPosRankSum=-0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,22:37:99:487,0,345 2 127928186 . T C 144.40 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:177,15,0 2 130254292 rs541498825 A G 501.93 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:45.14:535,45,0 2 130697710 . C T 40.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:71,6,0 2 130951566 . G A 32.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.15;MQ0=1;QD=10.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6.01:64,6,0 2 133016495 rs568137892 T G 31.68 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.81;MQ0=0;QD=15.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:63,6,0 2 139044852 . A G 862.35 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:75.23:895,75,0 2 139045204 . T C 146.15 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:179,15,0 2 139045294 . G A 288.67 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:27.08:322,27,0 2 139045445 rs536802099 T A 41.02 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=15;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6.02:72,6,0 2 139045972 . T C 603.30 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:54.16:636,54,0 2 139046301 . A G 827.97 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:72.22:861,72,0 2 139046385 . G A 362.67 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:33.10:396,33,0 2 159281875 . A G 63.35 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=3.979;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:57.21:93,0,57 2 161135544 . C T 85.70 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.729;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.28;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.36;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:116,0,142 2 161135991 . T C 742.50 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.809;DP=64;Dels=0.00;FS=2.478;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,30:64:99:772,0,837 2 161223688 . T A 374.27 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;DP=40;Dels=0.00;FS=1.397;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=9.36;ReadPosRankSum=-1.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:404,0,546 2 161258649 . T TAAC 373.80 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.058;DP=26;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=281.3827;MQ=37.43;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=14.38;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,7:26:99:413,0,519 2 161258656 . T A 204.76 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.418;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=8.53;ReadPosRankSum=-1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:235,0,234 2 161265071 . C T 369.13 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.717;DP=47;Dels=0.00;FS=3.211;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=7.85;ReadPosRankSum=1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:399,0,611 2 161265099 . C A 337.26 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.918;DP=39;Dels=0.00;FS=1.527;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.650;QD=8.65;ReadPosRankSum=-1.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:367,0,587 2 170648470 . G T 1214.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1248,105,0 2 170649930 . C T 179.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:18.05:212,18,0 2 170649949 . A G 58.11 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=1.9330;MQ=35.87;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:23.22:88,0,23 2 170649951 . A G 90.37 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:20.21:120,0,20 2 170650338 . G A 897.60 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:78.24:931,78,0 2 170657670 . A G 65.49 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:23.22:95,0,23 2 170662634 . C A 360.04 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:33.10:393,33,0 2 170969040 . T C 41.02 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6.02:72,6,0 2 170975873 . G C 74.60 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:107,9,0 2 175174236 . G A 692.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.78;MQ0=0;QD=25.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:63.16:725,63,0 2 175174281 . T C 873.12 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.22;MQ0=0;QD=27.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:78.20:906,78,0 2 175174922 . T C 238.97 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.87;MQ0=7;QD=13.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:24.04:272,24,0 2 178080690 . A G 77.54 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.289;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=5.96;ReadPosRankSum=1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:108,0,250 2 178085137 . G A 539.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:48.15:573,48,0 2 178085827 . C T 1104.16 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.09;MQ0=0;QD=29.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:96.29:1137,96,0 2 178087165 . G T 931.97 . 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AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.812;DP=51;FS=11.563;HRun=11;HaplotypeScore=635.8257;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=1.67;ReadPosRankSum=2.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,5:51:99:124,0,273 2 179094245 . C A 40.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6.02:71,6,0 2 190788844 . T TC 173.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=12;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=153.3170;MQ=37.63;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.48;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,9:12:10.62:215,11,0 2 195052314 . T C 838.70 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.26;MQ0=0;QD=20.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:75.21:872,75,0 2 195052367 . C A 354.72 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.22;MQ0=0;QD=18.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:36.08:388,36,0 2 195053076 . C A 535.43 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:48.15:568,48,0 2 195053162 . G GA 286.43 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;HRun=10;HaplotypeScore=226.8685;MQ=36.78;MQ0=0;QD=16.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,14:17:33.05:328,33,0 2 195053481 . T G 74.60 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:107,9,0 2 197881357 . C T 62.47 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:57.21:92,0,57 2 201928485 . A G 579.62 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.95;MQ0=1;QD=15.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:63.02:613,63,0 2 201928609 . C T 354.06 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.461;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:384,0,418 2 201929086 . C T 32.65 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.880;DP=24;Dels=0.00;FS=6.317;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.71;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=1.36;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,6:24:62.64:63,0,288 2 202569992 rs756930928 A T 482.66 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.322;DB;DP=36;Dels=0.00;FS=1.814;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=13.41;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:513,0,435 2 202570232 . A G 91.71 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=13.10;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:84.70:122,0,85 2 202574825 . C T 429.67 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:39.12:463,39,0 2 202575821 rs776093324 G A 223.33 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.094;DB;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:253,0,430 2 202580370 . G A 144.16 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;DP=17;Dels=0.00;FS=5.756;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:174,0,212 2 202587353 . C T 237.88 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:268,0,233 2 202587583 . C A 790.95 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;DP=83;Dels=0.00;FS=3.711;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=9.53;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,42:83:99:821,0,932 2 202587586 . T C 699.36 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;DP=79;Dels=0.00;FS=6.223;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=8.85;ReadPosRankSum=1.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,39:79:99:729,0,873 2 202587653 . C T 346.29 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.197;DP=38;Dels=0.00;FS=3.485;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:376,0,482 2 202588250 . C T 90.83 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:87.32:121,0,87 2 202598113 . C T 99 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;DP=25;Dels=0.00;FS=2.060;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:129,0,341 2 202603147 . A G 74.60 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9.03:107,9,0 2 202606193 . C T 40.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6.02:71,6,0 2 202606639 . G A 111.15 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:144,12,0 2 202608877 . C A 40.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6.02:71,6,0 2 202614632 . T G 62.47 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:56.34:92,0,56 2 202625615 . C T 684.29 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;DP=61;Dels=0.00;FS=4.125;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,28:61:99:714,0,682 2 202630368 . A ATACTT 279.44 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;DP=14;FS=2.522;HRun=0;HaplotypeScore=104.5150;MQ=37.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=19.96;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:318,0,481 2 204637162 . G T 287.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:27.08:321,27,0 2 206814829 . C T 63.35 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=10;Dels=0.00;FS=3.979;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.33;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:56.34:93,0,56 2 207025444 rs374271489 T C 678.25 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.425;DB;DP=49;Dels=0.00;FS=12.451;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,28:49:99:708,0,390 2 207027407 . C CT 245.65 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;DP=19;FS=7.911;HRun=3;HaplotypeScore=132.1110;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:285,0,345 2 212242192 . A C 1075.62 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:93.28:1109,93,0 2 212242434 . G A 359.17 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:33.10:392,33,0 2 212242641 . G A 1184.01 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1217,102,0 2 212243422 . G A 753.08 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:36:66.20:786,66,0 2 212243612 . CTT C 281.24 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;HRun=13;HaplotypeScore=347.5914;MQ=38.34;MQ0=0;QD=11.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:36.18:323,36,0 2 212243703 . G T 679.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=7;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.49;MQ0=0;QD=29.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:60.18:713,60,0 2 212244666 . T A 476.52 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:507,0,436 2 212244761 . A AG 1080.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=108.2842;MQ=38.29;MQ0=0;QD=41.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:72.24:1123,72,0 2 212244952 . G A 826.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:72.22:859,72,0 2 212245284 . A G 972.49 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:84.26:1005,84,0 2 212245489 . A G 754.83 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:66.20:788,66,0 2 212247834 . C T 466.67 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:42.13:500,42,0 2 212251864 . T C 863.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:75.23:896,75,0 2 212252809 . G A 74.60 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:107,9,0 2 212488870 . G GC 260.72 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=80.4686;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:303,21,0 2 212569983 . G A 31.49 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26.23:61,0,26 2 212576980 . T C 277.90 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-1.573;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=17.37;ReadPosRankSum=-1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:308,0,168 2 212578439 . C A 96.47 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.08;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:53.33:126,0,53 2 212587321 . G A 321.29 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:30.09:354,30,0 2 212589986 . T C 217.29 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.212;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:247,0,140 2 212615516 . T C 720.46 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:63.19:753,63,0 2 212989308 . T C 313.15 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.9989;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:343,0,131 2 216975305 . G A 86.59 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.197;DP=29;Dels=0.00;FS=2.236;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=2.99;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:117,0,508 2 216982178 . G A 379.03 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.576;DP=39;Dels=0.00;FS=10.916;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:409,0,516 2 217012901 . A G 230.63 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.590;DP=40;Dels=0.00;FS=6.057;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:261,0,692 2 217039064 . G T 60.34 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:88.58:90,0,89 2 217039361 . T C 62.47 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=12.49;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:56.34:92,0,56 2 217039695 . T G 59.46 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.988;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:87.70:89,0,88 2 217055151 . T C 76.66 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=4.03;ReadPosRankSum=-1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:107,0,251 2 217055171 . A G 182.15 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:18.05:215,18,0 2 217057484 . T A 184.17 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.135;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=14.17;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:214,0,143 2 217069151 . A G 318.43 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.230;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:348,0,489 2 217069876 . T G 110.66 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.696;DP=19;Dels=0.00;FS=3.123;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:141,0,246 2 217070376 . A G 535.99 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.905;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,27:55:99:566,0,562 2 217070766 . G A 305 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.124;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:335,0,228 2 219066484 . G A 109.40 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12.04:142,12,0 2 219066518 . T C 33.25 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26.23:63,0,26 2 220136155 . T C 50.96 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=20.57;MQ0=1;QD=10.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9.01:83,9,0 2 220136371 . T C 31.68 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.00;MQ0=0;QD=10.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6.01:63,6,0 2 222282765 . C T 74.60 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9.03:107,9,0 2 222282959 . G T 431.42 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:464,39,0 2 222283000 . A T 434.05 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:39.12:467,39,0 2 222283281 rs573198197 T C 1006.86 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:87.27:1040,87,0 2 222283504 . C T 1144.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1177,99,0 2 222283514 . C T 1184.01 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1217,102,0 2 222284034 . G C 667.11 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:84.26:1002,84,0 2 222320066 . G A 75.48 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:108,9,0 2 222320427 . G A 1006.86 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:87.27:1040,87,0 2 222321225 . C T 181.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:214,18,0 2 222367483 . G A 41.02 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:72,6,0 2 222438968 . A G 894.97 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:35:78.24:928,78,0 2 231436770 . C A 141.94 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=18;Dels=0.00;FS=9.700;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=22.54;MQ0=10;MQRankSum=-1.067;QD=7.89;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:47.33:172,0,47 2 231436871 . C G 88.70 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:119,0,119 2 231437013 . A G 236.59 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.567;DP=38;Dels=0.00;FS=3.699;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.17;MQ0=7;MQRankSum=0.518;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:267,0,426 2 231437079 . C T 340.27 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;DP=43;Dels=0.00;FS=1.758;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.301;QD=7.91;ReadPosRankSum=1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:370,0,550 2 231437810 . T C 185.05 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.134;DP=15;Dels=0.00;FS=2.398;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:215,0,143 2 231438198 . C T 212.15 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.340;DP=17;Dels=0.00;FS=2.447;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:242,0,206 2 231438296 . A G 108.79 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=0.684;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.66;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:82.57:139,0,83 2 231438347 . C T 85 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.85;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:85.58:115,0,86 2 231438421 . T C 145.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:15.05:178,15,0 2 231438650 . T C 90.83 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:85.57:121,0,86 2 232324780 . A G 157.95 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=1.683;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=17.55;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:78.68:188,0,79 2 232326801 . A T 336.77 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-2.102;DP=52;Dels=0.00;FS=3.477;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.81;MQ0=0;MQRankSum=1.942;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,25:52:99:367,0,544 2 232328681 . C T 434.05 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:39.12:467,39,0 2 239141505 . A G 80.26 . AC=1;AF=0.50;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.96;MQ0=1;MQRankSum=-1.484;QD=2.77;ReadPosRankSum=-0.524 GT:A